Популярность Agile методологий, особенно Scrum, в проектах разработки программного обеспечения очевидна. Не зря PMI запускает Agile сертификацию. Я составил список систем управления задачами (проектами), реализующих основные черты подхода Scrum. 
Последние сорок лет в мире непрерывно набирают популярность так называемые карты памяти (mind map). Их используют для организации записей, для выработки новых идей при мозговом штурме, проведения совещаний, для различных форм коллективной работы и презентаций. Инструментами для создания карт памяти пользуются многие руководители проектов. Какие платные и бесплатные варианты можно рассмотреть?
Достаточно интересной и, главное, бесплатной заменой локальной версии MS Project является Openproj.